Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CALCOCO2Q13137 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CALCOCO2Q13137 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CALCOCO2Q13137 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CALCOCO2Q13137 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CALCOCO2Q13137 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CALCOCO2Q13137 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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