Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GPS1Q13098 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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