Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BNIP3Q12983 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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