Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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BNIP1Q12981 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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BNIP1Q12981 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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BNIP1Q12981 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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BNIP1Q12981 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BNIP1Q12981 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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