Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STX4Q12846 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STX4Q12846 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STX4Q12846 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STX4Q12846 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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STX4Q12846 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STX4Q12846 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STX4Q12846 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STX4Q12846 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
STX4Q12846 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STX4Q12846 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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STX4Q12846 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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STX4Q12846 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
STX4Q12846 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
STX4Q12846 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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