Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFEMP1Q12805 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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