Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARHGEF5Q12774 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARHGEF5Q12774 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms