Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
HMGXB3Q12766 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HMGXB3Q12766 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
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