Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms