Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms