Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP4Q07065 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP4Q07065 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms