Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAD51Q06609 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms