Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB3Q05901 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms