Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF11Q05519 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms