Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN12Q05209 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms