Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF85Q03923 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms