Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG4Q00888 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms