Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms