Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCCQ00597 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FANCCQ00597 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FANCCQ00597 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FANCCQ00597 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FANCCQ00597 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FANCCQ00597 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FANCCQ00597 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FANCCQ00597 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCCQ00597 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCCQ00597 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCCQ00597 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCCQ00597 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCCQ00597 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCCQ00597 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms