Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PITPNAQ00169 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms