Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITX1P78337 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITX1P78337 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms