Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SUMO1P63165 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SUMO1P63165 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SUMO1P63165 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SUMO1P63165 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms