Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHOBP62745 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHOBP62745 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms