Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms