Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME5P56597 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME5P56597 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NME5P56597 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NME5P56597 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME5P56597 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms