Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRPF1P55201 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms