Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EPHB3P54753 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms