Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP98P52948 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP98P52948 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP98P52948 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP98P52948 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP98P52948 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP98P52948 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP98P52948 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP98P52948 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP98P52948 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP98P52948 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP98P52948 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP98P52948 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP98P52948 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP98P52948 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP98P52948 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP98P52948 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP98P52948 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP98P52948 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP98P52948 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP98P52948 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP98P52948 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP98P52948 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUP98P52948 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUP98P52948 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUP98P52948 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms