Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRE11P49959 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRE11P49959 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRE11P49959 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRE11P49959 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms