Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL29P47914 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL29P47914 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL29P47914 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL29P47914 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL29P47914 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms