Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms