Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CHI3L1P36222 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms