Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms