Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCGF2P35227 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PCGF2P35227 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms