Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSG3P32926 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSG3P32926 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSG3P32926 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSG3P32926 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSG3P32926 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms