Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAP3P28838 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAP3P28838 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAP3P28838 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAP3P28838 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAP3P28838 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAP3P28838 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAP3P28838 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAP3P28838 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAP3P28838 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAP3P28838 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAP3P28838 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms