Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSFA2P28290 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms