Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCD3P28288 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCD3P28288 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCD3P28288 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCD3P28288 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCD3P28288 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCD3P28288 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ABCD3P28288 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCD3P28288 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCD3P28288 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCD3P28288 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCD3P28288 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ABCD3P28288 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms