Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL3RAP26951 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms