Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMLP26374 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMLP26374 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMLP26374 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMLP26374 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMLP26374 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMLP26374 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMLP26374 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMLP26374 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMLP26374 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHMLP26374 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHMLP26374 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHMLP26374 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms