Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA3P26006 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms