Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXA5P20719 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA5P20719 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA5P20719 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA5P20719 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA5P20719 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA5P20719 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA5P20719 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HOXA5P20719 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA5P20719 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA5P20719 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms