Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms