Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC3P19447 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms