Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCLP19338 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCLP19338 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCLP19338 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCLP19338 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCLP19338 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCLP19338 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCLP19338 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCLP19338 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCLP19338 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCLP19338 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCLP19338 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms