Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHCEP18577 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RHCEP18577 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHCEP18577 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHCEP18577 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms