Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCSHP14314 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCSHP14314 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms