Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PF4V1P10720 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms