Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms