Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RD3LP0DJH9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms